bovini - servizi
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identificazione genetica e diagnosi di parentela
Il test si basa sull’uso di un pannello di 18 marcatori microsatelliti validati dall’ISAG (International Society of Animal Genetics). Per la specie bovina l’ISAG ha validato anche un panello di 200 marcatori SNP che LGS analizza mediante Illumina® SNP chip come servizio complementare alle analisi genomiche.
Microsatelliti analizzati: BM1824, BM2113, ETH3, ETH10, ETH225, INRA023, SPS115, TGLA227, TGLA53, TGLA122, TGLA126, AGLA293, BM1818, CYP21, INRA005, MGTG4B, SPS113, TGLA57.
SNP analizzati: scarica la lista dei 200 SNP validati dall'ISAG.
Tracciabilità
Tracciabilità genetica della carne: è un test di tracciabilità individuale che viene eseguito con il pannello di marcatori microsatelliti e confronta il genotipo del “taglio di carne” con il genotipo del putativo animale da cui dovrebbe derivare e indicato come genotipo più probabile.
Tracciabilità genetica di razza: applicabile su carne e latte e formaggi. Attualmente, le moderne tecniche di biologia molecolare permettono di effettuare analisi partendo da qualsiasi matrice biologica, anche le meno adatte, come il formaggio a pasta dura e a lunga conservazione. LGS ha sviluppato un metodo per effettuare l'analisi di tracciabilità di formaggi tipici monorazza. Il protocollo si basa sull'analisi di un gene che influenza il colore del mantello dei bovini, l'MC1R, potenzialmente razza specifico. La presenza o l'assenza di questi alleli determina l'attribuzione del latte e, di conseguenza, del formaggio ad una razza piuttosto che a un'altra. La stessa metodologia può essere applicata ugualmente alle carni per distinguere razze da latte e da carne.
Tracciabilità genetica di specie: applicabile su preparati alimentari a base di carne e su formaggi e latticini. Si basa sull’individuazione di sequenze di DNA mitocondriale specie-specifiche.
genomica
SNP chip a varie densità sviluppati da Illumina® e/o da GeneSeek® (Neogen) sono disponibili per bovini da latte e da carne. Per i bovini, con un’unica analisi è possibile ottenere il massimo dell’informazione (analisi genomiche, diagnosi di parentela, aplotipi correlati a malattie genetiche, aplotipi correlati a caratteristiche morfo-funzionali, geni che influenzano i caratteri produttivi o la qualità dei prodotti) evitando molteplici analisi specifiche che comportano costi più elevati. Chip disponibili:
- GeneSeek® Genomic Profiler™ Bovine LDv4: più di 30.000 marcatori, inclusi una serie SNP legati a malattie, a caratteri produttivi e per diagnosi di parentela. 24 campioni per chip.
- GeneSeek® Genomic Profiler™ Bovine HDv3 (150K): più di 140.000 SNP a campione per aumentare il potere di selezione genomica, ideale per imputare con set di marcatori ad alta densità come supporto alla ricerca e per una predizione più accurata degli animali d’élite. Include SNP legati a malattie, a caratteri produttivi e per parentela. 24 campioni per chip
- Illumina® BovineSNP50v3: 54.609 SNP a campione, 24 campioni per chip
- Illumina® BovineHD: chip ad alta densità da 777K SNP a campione, 8 campioni per chip
- Axiom® BovMDv3: 65K SNP a campione, 96/384 campioni per chip
assegnazione di razza
Il test si basa sull’analisi di marcatori microsatelliti o SNP (per le specie che hanno pannelil ben definiti) e sull’attribuzione probabilistica di un individuo ad un set di popolazioni di riferimento costituite ad hoc. LGS ha a disposizione alcuni set di popolazioni di riferimento per razze da latte e da carne ma è possibile costituirne di nuove in base alle necessità. Applicabile sui campioni (ad es., tagli di carne) di provenienza incerta o come strumento di valorizzazione della qualità della carne stessa.
Diagnosi malattie genetiche
Nelle tabelle seguenti sono elencate le analisi disponibili. Nella colonna TEST è indicato il tipo di tecnologia con cui possono essere condotte le analisi:
- 1 discriminazione allelica tramite RealTime, Kasp™, elettroforesi capillare
- 2: analisi data in subappalto a terzi
- 3: analisi genomica con GeneSeek® Genomic Profiler™ Bovine LDv2 (26K), codice servizio BGL [DISMESSO]
- 4: analisi genomica con GeneSeek® Genomic Profiler™ Bovine HDv3 (150K), codice servizio BGC
- 5: analisi genomica con GeneSeek® Genomic Profiler™ Bovine LDv4 (33K), codice servizio BL3
Nella colonna EXTRA è indicato se oltre al costo dell'analisi genomica è necessario pagare un supplemento.
| GENE | RAZZA | TEST | EXTRA | INFO |
|---|---|---|---|---|
| Albinismo | Charolais/varie | 3,4,5 | >> | |
| Arachnomelia | Bruna, Simmental | 3,4,5 | >> | |
| BLAD - Bovine leukocyte adhesion deficiency | Frisona | 1,3,4,5 | >> | |
| Brachyspina (BY) | Frisona | 3,4,5 | S | >> |
| Citrullinemia | Frisona | 3,4,5 | >> | |
| CVM - Complex vertebral malformation | Frisona | 1,3,4,5 | S | >> |
| Dilated-cardiomyopathy | Frisona | 3,4,5 | >> | |
| DUMPS - Deficiency of Uridine monophosphate synthase | Frisona | 3,4,5 | >> | |
| Epidermolysis bullosa (EB) | Chianina | 3,4,5 | >> | |
| Fattore 11 | Frisona, Wagyu | 3,4,5 | >> | |
| Ichthyosis fetalis | Chianina | 3,4,5 | >> | |
| Sindattilismo/Mulefoot | Simmental, Frisona, Meticci | 3,4,5 | >> | |
| SMA - Spinal muscular atrophy | Bruna, razze Europee | 3,4,5 | >> | |
| Spinal dysmyelination (BSD) | Bruna | 3,4,5 | >> | |
| Weaver - Progressive degenerative myeloencephalopathy | Bruna | 3,4,5 | >> |
diagnosi caratteri produttivi & qualitativi
Nelle tabelle seguenti sono elencate le analisi disponibili. Nella colonna TEST è indicato il tipo di tecnologia con cui possono essere condotte le analisi:
- 1 discriminazione allelica tramite RealTime, Kasp™, elettroforesi capillare
- 2: analisi data in subappalto a terzi
- 3: analisi genomica con GeneSeek® Genomic Profiler™ Bovine LDv2 (26K), codice servizio BGL [DISMESSO]
- 4: analisi genomica con GeneSeek® Genomic Profiler™ Bovine HDv3 (150K), codice servizio BGC
- 5: analisi genomica con GeneSeek® Genomic Profiler™ Bovine LDv4 (33K), codice servizio BL3
Nella colonna EXTRA è indicato se oltre al costo dell'analisi genomica è necessario pagare un supplemento.
GENI DEL LATTE
Comprendono una serie di geni che influenzano le caratteristiche del latte.
| GENE | RAZZA | TEST | EXTRA | INFO |
|---|---|---|---|---|
| Beta caseina A/B | Razze da latte | 1,3,4,5 | >> | |
| Beta caseina A2 | Razze da latte | 1,3,4,5 | S | >> |
| Beta caseina A3 | Razze da latte | 3,4,5 | >> | |
| Beta lattoglobulina | Razze da latte | 1,3,4,5 | >> | |
| Beta caseina C, E, F, H, I, K, L | Razze da latte | 4,5 | S | >> |
| K caseina | Frisona, Jersey, Bruna | 1,3,4,5 | >> |
CARATTERISTICHE MORFO FUNZIONALI
Comprendono una serie di geni riguardanti l'aspetto e caratteristiche funzionali.
| GENE | RAZZA | TEST | EXTRA | INFO |
|---|---|---|---|---|
| MC1R (gene del colore) | diverse razze | 1,4,5 | S | >> |
| Dominant red | Frisona | 4,5 | S | >> |
| Polled | diverse razze | 1,4,5 | >> | |
| Aplotipo fertilità HH1, HH3, HH4 | Frisona | 3,4,5 | >> | |
| Aplotipo fertilità JH1 | Jersey | 3,4,5 | >> |
richiesta servizi
Per una descrizione completa dei servizi si consulti la pagina SERVIZI. A richiesta sono disponibili anche i servizi di genetica forense e sviluppo di test specifici
Per richiedere un servizio scaricare e compilare l'apposito modulo seguendo le istruzioni in esso contenute. Il modulo deve essere allegato al campione che va inviato al seguente indirizzo.
Il prelievo del campione deve essere eseguito secondo quanto suggerito nelle modalità di campionamentoIl cliente è pregato di prendere visione delle modalità di pagamento, delle condizioni generali di sevizio e dell'informativa sulla privacy reperibili alla pagina info, dove si possono trovare ulteriori informazioni.